Zwiebeln schälen und dünn schneiden. In Butter bei mittlerer Hitze 8-10 Minuten sautieren, bis sie durchsichtig und leicht karamellisiert sind. Thymian und Muskat hinzufügen und abkühlen lassen.

In einer großen Schüssel Mehl, Backpulver, Salz und Pfeffer kombinieren, bis keine Klumpen mehr vorhanden sind.

In einer anderen Schüssel Milch, Joghurt, Eier und Öl gut vermengen, bis die Mischung cremig ist.

Trockene Zutaten vorsichtig unter die feuchte Mischung heben, dann die abgekühlte Zwiebelmischung und den Käse sanft unterheben.

Ofen auf 180°C vorheizen, Muffinblech mit Papierförmchen auslegen und Teig einfüllen. Muffins 25-30 Minuten backen, bis sie goldbraun sind.

Muffins 5 Minuten im Blech abkühlen lassen, dann auf ein Gitter setzen. Warm genießen.